Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtlP38585 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtlP38585 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtlP38585 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TtlP38585 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms