Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PpargP37238 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpargP37238 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms