Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms