Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim2P33610 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms