Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc11P31313 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms