Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctnnd1P30999 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms