Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprmP28828 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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