Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vav1P27870 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vav1P27870 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms