Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PdgfraP26618 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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PdgfraP26618 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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PdgfraP26618 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PdgfraP26618 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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PdgfraP26618 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PdgfraP26618 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdgfraP26618 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms