Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CftrP26361 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CftrP26361 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CftrP26361 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CftrP26361 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CftrP26361 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CftrP26361 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CftrP26361 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CftrP26361 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CftrP26361 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CftrP26361 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CftrP26361 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CftrP26361 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CftrP26361 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 507.9 ms