Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms