Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RarbP22605 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RarbP22605 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RarbP22605 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RarbP22605 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RarbP22605 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RarbP22605 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RarbP22605 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RarbP22605 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms