Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmnb2P21619 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms