Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou5f1P20263 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms