Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P20040 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P20040 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P20040 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P20040 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P20040 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
P20040 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
P20040 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
P20040 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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