Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RargP18911 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RargP18911 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RargP18911 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RargP18911 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RargP18911 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RargP18911 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RargP18911 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RargP18911 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms