Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka1P18653 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka1P18653 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms