Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms