Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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