Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp53P15975 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp53P15975 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms