Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms