Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmnb1P14733 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms