Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnmt1P13864 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnmt1P13864 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms