Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scd1P13516 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms