Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms