Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr4a1P12813 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms