Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb1P12658 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms