Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lire1P11260 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms