Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prf1P10820 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prf1P10820 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prf1P10820 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms