Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P10404 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P10404 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P10404 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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