Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms