Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TnfP06804 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TnfP06804 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms