Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
JunP05627 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
JunP05627 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
JunP05627 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JunP05627 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms