Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01741 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01741 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01741 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01741 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01741 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01741 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01741 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01741 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01741 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01741 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms