Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01646 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01646 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01646 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01646 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01646 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01646 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01646 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01646 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01646 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01646 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01646 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01646 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms