Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01645 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01645 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01645 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01645 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01645 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01645 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01645 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01645 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01645 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01645 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01645 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01645 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms