Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms