Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sypl2O89104 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl2O89104 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms