Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BlmO88700 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BlmO88700 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BlmO88700 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BlmO88700 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms