Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkcO88445 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms