Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pknox1O70477 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pknox1O70477 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pknox1O70477 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pknox1O70477 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pknox1O70477 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pknox1O70477 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pknox1O70477 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pknox1O70477 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pknox1O70477 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pknox1O70477 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pknox1O70477 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pknox1O70477 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pknox1O70477 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pknox1O70477 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pknox1O70477 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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