Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtssO70370 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtssO70370 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtssO70370 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtssO70370 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtssO70370 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtssO70370 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtssO70370 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtssO70370 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms