Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Foxq1O70220 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxq1O70220 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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