Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Eif6O55135 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif6O55135 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms