Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrxO55103 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrxO55103 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrxO55103 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrxO55103 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrxO55103 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrxO55103 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrxO55103 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrxO55103 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrxO55103 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrxO55103 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrxO55103 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms