Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rdh16O54909 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16O54909 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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