Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp10aO54827 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms