Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DffaO54786 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DffaO54786 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms