Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CaluO35887 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CaluO35887 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CaluO35887 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms