Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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